Em uma noite escura, a polícia japonesa é invadida por um espião. Agências de inteligência de diferentes países — como o MI6 da Inglaterra, o BDN da Alemanha e a CIA dos Estados Unidos — bem como os arquivos secretos do FBI serão levados, mas agentes de segurança pública liderados por Tooru Amuro chegam bem a tempo. O espião rouba um carro e foge. O espião e Amuro ficam em um impasse na rodovia e, quando está prestes a causar um acidente com vários carros, o carro do espião é atingido pela bala de rifle do agente do FBI Shuichi Akai e cai da estrada. No dia seguinte, Conan e seus amigos vão a um aquário recém-reformado em Tóquio. Sob a atração principal, uma roda-gigante, Conan encontra uma mulher atraente sozinha e ferida. Seus olhos esquerdo e direito são de cores diferentes.