Setsuna, um estudante do Ensino Médio, não só precisa lidar com valentões e sentimentos mais do que apropriados pela própria irmã, como também precisa aceitar o fato de ser a reencarnação do Anjo Orgânico Alexiel, que se rebelou contra Deus. Ao ser lançado em um mundo que nunca soube que existia, ele precisa acreditar que anjos e demônios existem para o bem do Céu, da Terra e até do Inferno.